基因组组装
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已有的泛基因组工具https://github.com/ekg/fastix[https://github.com/ekg/fastix]， 但是没有优化速度。我推荐使用se...
在使用激光雷达进行样地调查时，我们常常会面临一个问题：明明只扫描了一个样地，导出的点云数据却覆盖了周围一大片区域。如下图所示： 为什么会这样？因为激光雷达的扫描距离通常很远，...
2023年10月3日李恒课题组在Bioinformatics在线发表了compleasm: a faster and more accurate reimplementati...
Cupcake是一个三代测序后续分析软件的集合,其中包含的ToFu软件可进行转录本的修剪（collapse_isoforms_by_sam.py）以及融合基因（fusion_...
前言 近期分析了一部分小麦的全长转录组数据，参考了网上许多流程，收获良多，在此记录一下 全长转录组测序基于PacBio单分子实时测序技术（SMRT cell）,凭借超长读长的...
因为课题需要，我们在前期组装了一个基因组并进行了注释，但是存在两个问题，一个是没有考虑可变剪切，另一个是注释的基因并不准确，三代转录组的广泛普及对于基因研究提供了很大的便利，...
二.变异结果注释与统计 书接上回//www.greatytc.com/p/ab6a35502786[//www.greatytc.com/p/ab6a35...
作者：Aron审稿：童蒙编辑：amethyst 引言 长读长测序技术的突破使得转录本结构鉴定、可变剪切等分析更为准确。上一期我们介绍了Iso-seq方法鉴定全长转录本：全长转...
Bismark是进行甲基化分析过程中常用到的软件，可以将bisulfite处理后的测序reads比对到参考基因组上，得到参考基因组相应位置的甲基化水平。 我的甲基化数据为WG...
前言 在遥感影像处理中，对栅格数据进行投影转换是一项常见的预处理任务。然而，在实际工作中，我们有时会遇到影像坐标系信息丢失的情况，尽管其坐标值本身是正确的。此时，我们仍需要为...
