在使用激光雷达进行样地调查时,我们常常会面临一个问题:明明只扫描了一个样地,导出的点云数据却覆盖了周围一大片区域。如下图所示: 为什么会这样?因为激光雷达的扫描距离通常很远,...
在使用激光雷达进行样地调查时,我们常常会面临一个问题:明明只扫描了一个样地,导出的点云数据却覆盖了周围一大片区域。如下图所示: 为什么会这样?因为激光雷达的扫描距离通常很远,...
2023年10月3日李恒课题组在Bioinformatics在线发表了compleasm: a faster and more accurate reimplementati...
Cupcake是一个三代测序后续分析软件的集合,其中包含的ToFu软件可进行转录本的修剪(collapse_isoforms_by_sam.py)以及融合基因(fusion_...
前言 近期分析了一部分小麦的全长转录组数据,参考了网上许多流程,收获良多,在此记录一下 全长转录组测序基于PacBio单分子实时测序技术(SMRT cell),凭借超长读长的...
因为课题需要,我们在前期组装了一个基因组并进行了注释,但是存在两个问题,一个是没有考虑可变剪切,另一个是注释的基因并不准确,三代转录组的广泛普及对于基因研究提供了很大的便利,...
二.变异结果注释与统计 书接上回//www.greatytc.com/p/ab6a35502786[//www.greatytc.com/p/ab6a35...
作者:Aron审稿:童蒙编辑:amethyst 引言 长读长测序技术的突破使得转录本结构鉴定、可变剪切等分析更为准确。上一期我们介绍了Iso-seq方法鉴定全长转录本:全长转...
odgi 把GFA文件按染色体拆分 odgi 提取PGGB泛基因组子图 gfabase 提取MC泛基因组子图 坐标系转换 gfa 有路径信息和Node信息,有时候为了研究需要...
Bismark是进行甲基化分析过程中常用到的软件,可以将bisulfite处理后的测序reads比对到参考基因组上,得到参考基因组相应位置的甲基化水平。 我的甲基化数据为WG...