RNAseq全流程 1. hisat2比对 2.进行bam文件排序和生成索引 3.进行基因计数 4. Deseq分析绘图 环境安装: 1. hisat2比对 /home/sa...

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Python批量反向互补DNA碱基序列 输入文件: .xlsx输出文件:.xlsx 将需要进行反向互补的序列放入Excel文件中第一列,每一行对应一条序列,反向互补转换后的序...
Python 绘制 CRISPR sgRNA Counts均一度 分布曲线图 实现步骤: 读取Mageck分析后的Gene Counts表格,去表头 计算累计密度 计算分位数...
CRISPR-KO-KEGG-GO富集分析 代码如下:三个R文件: Func-CRIPSR (Func_CRISPR_20250519-Huh7-RAG.R) Func-K...
Python 几种输出格式
DESeq分析环境: 一份Counts表格,含有各组样品名和基因名 根据指定的两组分析,并画火山图和热图 1. 读取xlsx文件 2. 提取行名,转为数值后再设行名 3. 创...
.xlsx文件中 第一列有重复值,但是不想删除,需要都保留,现在有一个方案,有重复的值在后面添加_2,_3等 使用 Excel 原生功能实现 1 添加辅助列: 在 Excel...
Bliss协同矩阵分析 步骤: 通过高内涵或者酶标仪的下机数据,提取为矩阵读值,并标出相应浓度 计算生成不同药物浓度组合协同矩阵的抑制率文件,有标准格式 转成长数据,并保存为...
通过命令行运行R脚本文件: 在命令行中,导航到脚本文件所在的目录,并运行Rscript script.R。这将执行脚本中的所有代码,而不会进入互动界面 在命令行中直接运行单行...
VScode Python 配置 快速运行 Ctrl + Alt + N 快捷键运行程序 1 Code runner 插件配置: Ctrl + Alt + N 快捷键运行程序...
思考过程: 好的,我现在需要解决的问题是根据给定的SAM文件中的某行数据,统计所有测序比对行相对于参考序列的突变频率,特别是每个碱基突变成特定碱基的频数和频率占比。首先,我需...
Python绘图-IC50-IC20-IC5计算 绘图效果如下: 运行结果如下: 代码如下:
桌面万年历 功能如下: 1 万年历2 农历3 年月日时分秒4 天气5 历史上的今天6 每日一句 软件桌面效果如下: 代码如下:
@Gardenia_3859 错误: 【Missing required datasets 'levels' and 'values'】 这段报错提示 原始h5ad文件可能缺失部分数据, 确定一下h5ad文件完整性。另外可以考虑用Python读取分析,使用Python包 anndata或者scanpy读入数据,如下
data=anndata.read('data.h5ad')
# or
data=sc.read_h5ad('data.h5ad')
R 读取单细胞H5ad数据R 读取单细胞H5ad数据, 转换为Seurat能直接读取的对象 运行情况 需要一会儿时间,H5ad源文件大约 10GB 左右
python读取文本文件,生成词云图更改当前工作目录为脚本所在的目录去除标点符号和停用词添加过滤单字的逻辑生成概览总结提高词云图的清晰度黑体字 代码如下:
代码如下:
R绘图配色方案 R代码如下: 如需要再GraphPad中使用颜色,需要RGB颜色,可参考如下: Rmd文件如下:
在 qPCR 实验中,生物学重复和技术性重复的选择取决于实验目的、数据可靠性要求和操作标准化程度。以下是关键建议: 1. 技术性重复的作用 评估实验操作误差 :如移液不准确、...