2019-05-24

Windows下升级R3.6及Bioconductor3.9

查看R版本的方法:打开RStudio可以显示,截图如下:

R版本查看

升级R3.6命令:
安装installr:install.packages("installr") 如果已经安装了就略过这一步
升级:installr::updateR()
一路下去就可以了,我是在RStudio中进行的,注意一点就是中间有一布提示是否打开rGUI,这一步点No。
注意同意把原来的安装包复制到新的版本中。

升级到Bioconductor3.9

命令:BiocManager::install(version = "3.9")
升级完成后会提示升级相关的安装包,点击yes即可。
查看安装包的位置命令:.libPaths()
查看Bioconductor3.9版本命令:BiocManager::version()


备注:一开始用的是官方的命令
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install()
提示错误如下:Error: Bioconductor version '3.8' requires R version '3.5'

升级其他包

rvcheck::update_all()

更改R版本

在RStudio中的tools的global options中,更改后重启RStudio即可。


更改R版本
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