R语言中的数据结构

小知识

• r赋值 为<- 快捷键为alt +
• 显示工作路径getwd()
• 表格在 r 中称为数据框
• 函数、命令不懂时可以百度，或?read.table查看帮助文档
• 数据类型：向量（vector），数据框（data frame），矩阵（matrix），数组（array），list
  
  思维导图.jpg

向量

• 元素 向量 标量
  元素：数字或字符串 chr
  标量：一个元素组成的变量
  向量：多个元素组成的变量

x<- c(1,2,3) #常用的向量写法，意为将x定义为由元素1，2，3组成的向量。
x
x<- 1:10 #从1-10之间所有的整数
x
x<- seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数（注意是逗号不是分号）
x
x<- rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次
x

• 提取向量中元素

（1）根据位置

x[4] #x第4个元素
x[-4]#排除法，除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4]#第2到4个元素
x[-(2:4)]#除了第2-4个元素
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素

(2)根据数值

x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素

数据框

• 读取本地数据

read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header=T)

sep：字符分割
header：true则excel第一行用于列名称，具体数据从第二行开始；false则第一行即为具体数据

• 设置行名和列名

X<-read.csv('doudou.txt') #在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量X是一个数据框
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号，1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回数据，左上角第一格为空，R会自动补为x,用这个命令来修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名

csv和table均为数据框的储存形式，以csv提取具有更好的包容性和通融性。

• 数据框的导出

write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#数据框导出为文件“yu.txt”,分隔符改为逗号，字符串不加双引号（默认格式带由双引号） 

quote：字符串是否使用引号表示，默认为TRUE

• 变量保存和重新加载

save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(X,file="test.RData")#保存其中一个变量
load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令

• 提取元素

- X[x,y]#第x行第y列
- X[x,]#第x行
- X[,y]#第y列
- X[y] #也是第y列
- X[a:b]#第a列到第b列
- X[c(a,b)]#第a列和第b列
- X$列名#也可以提取列（优秀写法，而且这个命令还优秀到不用写括号的地步，并且支持Tab自动补全哦，不过只能提取一列）

问题回答

save(X,file="test.RData")报错的原因是，变量赋值是有可能付给了小写的x，而在保存时则找不到大写的X变量。