这一篇，我们继续总结，这里用到的PPT是我给产品技术培训用的PPT，当然了，有一些内容一笔带过，有的地方详细讲了讲，免费分享给大家，祝愿大家科研顺利，喜欢生物信息的，喜欢单细胞空间转录组的，都能在这个领域有所成就
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轨迹推断方式
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轨迹推断的软件总结
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最流行的方法，RNA速率
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最好的轨迹推断组合
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通讯软件合集
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通讯软件的最新进展
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单细胞最好的肿瘤识别方法
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一定要指定ref
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树形图体现异质性更加直观
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结合起来更加给力
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权重表达
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关联表型
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下游分析
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模块联系
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最好的寻找元程序的方法---NMF
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解释性更强
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元程序表征性更好
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单细胞 + VDJ，motif很重要
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TCR本身就可以寻找相似性
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核心半径难定义
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位点结合多态性
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两者hit更准确
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强强联合
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差异基因 & motif
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CoNGA更直观
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BCR分析更深入
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基因丰度表差异
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都是寻找motif
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单细胞 && 空间
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空间基因开关
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肿瘤边界微环境
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联合表征空间细胞分布
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肿瘤离得近，才能听得清
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空间通讯分析不能搞一刀切
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距离表征组织有序性
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你不来找我，我就来找你
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空间模块很重要
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空间表征显异质
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没有什么是模块不能划分的
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空间CNV图谱
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肿瘤确有异质性
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生活很好，有你更好，我们江湖再见
