问题最初产生于conda安装了java-jdk和fastqc后，fastqc仍然无法使用，用java --version确认之后发现java的VM存在问题。
于是手动下载了JAVA20，将路径加到了~/.bashrc中：

export JAVA_HOME=/home/ying/tools/jdk-20.0.1/
export PATH="$JAVA_HOME/bin:$PATH"

source后可以使用了，但是在生成html summary的时候，出现了以下错误：

经搜索发现大概是font字体问题，但是因为不是conda路径安装的java，所以conda install contconfig无效，没有root权限所以也无法sudo apt安装。

直到看到了一个这样的回答：https://stackoverflow.com/questions/76356076/cannot-load-from-short-array-because-sun-awt-fontconfiguration-head-is-null-th

于是从https://www.java.com/en/download/manual.jsp下载了jdk8，在jre1.8.0_371/lib/ 路径下找到了fontconfig.bcf和fonts/， 并把这些文件/文件夹复制到了JDK20（或者JDK17，都是一样的问题）的lib文件夹下。

再次运行fastqc，可以运行。