查找一个基因的启动子序列

如何查找某个gene的promoter sequence？

promoter sequence of a Gene from Ensembl

--以Ensembl为例--

  • 1 打开上述Ensembl网址，选择物种，以示例中的BRCA2为例



    点击上图红框

  • 2 点击sequence


    点击sequence

  • 3 粉色背景红色文本为exons，第一个exon前面的sequence即为promoter sequence，默认显示600bp。如果想显示自己想要数目的bp，按下面


窗口就会更新了。

  • 4为了确定是否正确（主要是TSS位点），可以把promoter sequence blast到UCSC genome broswer
    复制ensembl的 promoter sequence

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